Vestnik dermatologii i venerologiiVestnik dermatologii i venerologiiВестник дерматологии и венерологии0042-46092313-6294Rossijskoe Obschestvo Dermatovenerologov i Kosmetologov57110.25208/vdv571ArticlesСтатьиResearch ArticleResults of a study of genetic factors predisposing to the development of psoriasis among the population of the Russian FederationРезультаты изучения генетических факторов предрасположенности к псориазу среди населения Российской ФедерацииMINEYEVAA AМИНЕЕВАА А

м.н.с. отдела дерматологии

KOZHUSHNAYAO SКОЖУШНАЯО С

м.н.с. отделения молекулярных методов диагностики ИППП и болезней кожи

ZNAMENSKAYAL FЗНАМЕНСКАЯЛ Ф

к.м.н., зав. отделом дерматологии

CHIKINV VЧИКИНВ В

к.м.н., ст.н.с. отдела дерматологии

chikin@cnikvi.ruFRIGON VФригоН В

д.м.н., зам. директора по научно-образовательной работе

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology Ministry of Healthcare of the Russian FederationФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России15102013895NO5 (2013)№5 (2013)789011032020Copyright ©; 2013, MINEYEVA A.A., KOZHUSHNAYA O.S., ZNAMENSKAYA L.F., CHIKIN V.V., FRIGO N.V.Copyright ©; 2013, МИНЕЕВА А.А., КОЖУШНАЯ О.С., ЗНАМЕНСКАЯ Л.Ф., ЧИКИН В.В., Фриго Н.В.2013MINEYEVA A.A., KOZHUSHNAYA O.S., ZNAMENSKAYA L.F., CHIKIN V.V., FRIGO N.V.МИНЕЕВА А.А., КОЖУШНАЯ О.С., ЗНАМЕНСКАЯ Л.Ф., ЧИКИН В.В., Фриго Н.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://vestnikdv.ru/jour/article/view/571

Goal. To assess the incidence of genes predisposing to the development of psoriasis based on selected molecular and genetic study methods among the Russian population. Materials and methods. By using allele specific hybridization methods in the form of real-time PCR and RFLP assay (Restriction Fragment Length Polymorphism), single-nucleotide polymorphisms of fragments of 13 genes associated with predisposition to the development of psoriasis were studied in whole blood samples obtained from 45 psoriatic patients: rs4649203 (gene IL-28RA), rs11209026 (gene IL-23R), rs610604 (gene TNFAIP3), rs514315 (gene SERPINB8), rs9304742 (gene ZNF816A), rs17728338 (gene TNIP1), rs13190932 (gene TRAF3IP2), rs2235617 (gene ZNF313), rs27524 (gene ERAP1), rs702873 (gene REL), rs3213094 (gene IL-12B), rs12720356 (gene TYK2), and rs8016947 (gene NFKBI). Results. A set of data on the genotype structure and incidence in respective loci of 13 genes associated with predisposition to develop psoriasis was obtained for the first time based on a Russian sample of patients. At this stage of the study, we failed to reveal any reliable differences concerning the incidence of individual genotypes between psoriatic patients and healthy people because of the small size of the sample. Gene TYK2 (rs1272035) served as an exclusion. The homozygous T/T genotype was revealed more often (p < 0.01) in psoriatic patients (95.6%) vs. healthy people (77.8%), which makes it possible to consider the carriers of this genotype as people predisposed to the development of psoriasis.

Цель. Оценка частоты встречаемости в российской популяции генов предрасположенности к псориазу выбранными методами молекулярно-генетических исследований. Материал и методы. Методами аллель-специфической гибридизации в формате ПЦР в реальном времени и ПДРф-анализа (анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов) в образцах цельной крови, полученных от 45 больных псориазом, были изучены однонуклеотидные полиморфизмы фрагментов 13-и генов, ассоциированных с предрасположенностью к развитию псориаза: rs4649203 (ген IL-28RA), rs11209026 (ген IL-23R), rs610604 (ген TNFAIP3), rs514315 (ген SERPINB8), rs9304742 (ген ZNF816A), rs17728338 (ген TNIP1), rs13190932 (ген TRAF3IP2), rs2235617 (ген ZNF313), rs27524 (ген ERAP1), rs702873 (ген REL), rs3213094 (ген IL-12B), rs12720356 (ген TYK2), rs8016947 (ген NFKBI). Результаты. Впервые на российской выборке пациентов получен массив данных о структуре и частоте встречаемости генотипов в соответствующих позициях 13 генов, ассоциированных с предрасположенностью к развитию псориаза. На данном этапе исследования достоверных отличий в частоте встречаемости отдельных генотипов между больными псориазом и здоровыми выявлено не было ввиду относительной малочисленности выборки. Исключение составил ген TYK2 (rs1272035). Гомозиготный Т/Т генотип достоверно чаще (р < 0,01) встречался у больных псориазом (95,6%) в сравнении со здоровыми (77,8%), что позволяет рассматривать носителей данного генотипа как лиц с предрасположенностью к развитию псориаза.

SNPpsoriasispredispositiongenesSNPallele specific hybridizationreal-time PCRRFLP assaymolecular and genetic methodsпсориазпредрасположенностьгеныаллель-специфическая гибридизацияПЦР в реальном времениПДРФ-анализмолекулярно-генетические методыNestle F.O., Kaplan D.H., Barker. J. Psoriasis. N Engl J Med 2009; 361: 496-509.Elder J.T., Bruce A.T., Gudjonsson J.E. et al. Molecular dissection of psoriasis: integrating genetics and biology. J Invest Dermatol 2010; 130: 1213-1226.Федоров С.М. Псориаз: клинические и терапевтические аспекты. Рус. Мед. Журн. 2001; 9 (11): 447-451Знаменская Л.Ф., Мелехина Л.Е., Богданова Е.В., Минеева А.А. Заболеваемость и распространенность псориаза в Российской Федерации. Вестн дерматол. и венерол. 2012; 5: 20-29Gelfand J.M., Weinstein R., Porter S.B. et al. Prevalence and treatment of psoriasis in the United Kingdom: a population-based study. Arch Dermatol 2005; 141 (12): 1537-1541.Griffiths C.E., Barker J.N. Pathogenesis and clinical features of psoriasis. Lancet 2007; 370 (9583): 263-271.База данных Национального института здоровья США. http://www.genome.gov/gwastudies.Michailidis C., Karpouzis A., Kourmouli N. Notch2, notch4 gene polymorphisms in psoriasis vulgaris. Eur J Dermatol 2013; 23 (2): 146-153.Brookes, A.J. 1999. The essence of SNP. Gene 234: 177-186.Sachidanandam R, Weissman D, Schmidt SC et al. A map of human genome sequence variation containing 1.42 million single nucleotide polymorphisms. Cold Spring Harbor, New York 11724, USAХайрутдинов В.Р., Пономарев И.А., Жуков А.С. и др. Новая генетическая детерминанта псориаза - Ile479Leu полиморфизм гена каспазы-10. Вестн дерматол и венерол 2009; 1: 12-14Баранов В.С. Полиморфизм генов, экогенетические болезни и предиктивная персонализированная медицина. Экологическая генетика. 2011; 9 (3): 3-14Каганова Н.Л., Фриго Н.В., Знаменская Л.Ф. и др. Возможность прогнозирования клинического ответа на лечение больных псориазом. Вестн дерматол и венерол 2009; 4: 20-26Терман О.А., Шульман А.Я., Кухарева Е.Н. Полиморфизм RAGE-гена у больных псориазом. Вестн дерматол и венерол 2006; 5: 62-65Kwok P-Y. Methods for genotyping singlenucleotide polymorphisms. Annu Rev Genomics Hum Genet 2001 (2): 235-258Friedman K.J., Highsmith W.E., Jr., Prior T.W. et al. Cystic fibrosis deletion mutation detected by PCR-mediated site-directed mutagenesis. Clin Chem 1990; 36: 695-696Kalinina O., Lebedeva I., Brown J. et al. Nanoliter scale PCR with TaqMan detection. Nucleic Acids Res 1997; 25: 1999-2004Barany F. Genetic disease detection and DNA amplification using cloned thermostable ligase. Proc Natl Acad Sci U S A 1991; 88: 189-193Кофиади И.А., Ребриков Д.В. Методы детекции однонуклеотидных полиморфизмов: аллель-специфичный ПЦРигибридизация с олигонуклеотидной пробой. Генетика 2007; 26: 22-32Happich D., Madlener K., Schwaab R. et al. Application of the TaqMan-PCR for genotyping of the prothrombin G20210A mutation and of the thermolabile methylenetetrahydrofolate reductase mutation. Thromb Haemost 2000; 84 (1): 144-145Holland P.M., Abramson R.D., Watson R. et al. Detection of specific polymerase chain reaction product by utilizing the 5'-3' exonuclease activity of Thermus aquaticus DNA polymerase. Proc Natl Acad Sci U S A 1991; 88 (16): 7276-7280.Bouakaze C., Keyser C., De Martino S.J. et al. Identification and genotyping of Mycobacterium tuberculosis complex species by use of a SNaPshot Minisequencingbased assay. J Clin Microbiol. 2010; 48 (5): 1758-1766. Sankowski A.J., Lebkowska U.M., Cwikla J. Psoriatic arthritis. Pol J Radiol. 2013 Jan-Mar; 78(1): 7-17.Choi S.Y., Lee K.Y., Kim Y.E. et al. Application of allelespecific primer extension-based microarray for simultaneous multi-gene mutation screening in patients with non-syndromic hearing loss. Int J Mol Med 2010; 25(3): 315-320.Klinicheskaya biokhimiya: uchebnoe posobie. 3-e izdanie / pod red. V.A. Tkachuka. M.: GEOTAR-Media, 2008. [Клиническая биохимия: учебное пособие. 3-е издание / под ред. В.А. Ткачука. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2008.]Cooper D.N., Schmidtke J. DNA restriction fragment length polymorphisms and heterozygosity in the human genome. Hum Genet 1984; 66 (1): 1-16.Eiken H.G., Odland E., Boman H. et al. Application of natural and amplification created restriction sites for the diagnosis of PKU mutations. Nucleic Acids Res 1991; 19 (7): 1427-1430.Минеева А.А., Кожушная О.С., Волнухин В.А. и др. Изучение генетических факторов предрасположенности к развитию псориаза. Вестн дерматол и венерол 2012; 3: 30-38Borodina T. Metody detektsii SNP Institut Biologii Gena. [Бородина Т. «Методы детекции SNP» Институт Биологии Гена]. http://molbiol.edu.ru/review/04_03.html