Vestnik dermatologii i venerologiiVestnik dermatologii i venerologiiВестник дерматологии и венерологии0042-46092313-6294Rossijskoe Obschestvo Dermatovenerologov i Kosmetologov59410.25208/vdv594ArticlesСтатьиResearch ArticleFirst experience of molecular typing and determining the antibiotic resistance of syphilis pathogen Treponema pallidum in the Russian FederationПервый опыт молекулярного типирования и определения антибиотикорезистентности штаммов возбудителя сифилиса Treponema pallidum в Российской ФедерацииKubanovaA AКубановаА А

академик РАМН, д.м.н., профессор, директор

KubanovA AКубановА А

д.м.н., профессор, заместитель директора

FrigoN VФригоН В

д.м.н., заместитель директора

VolkovI AВолковИ А

к.б.н., старший научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней

RotanovS VРотановС В

д.м.н., доцент, главный научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней

rotanov@cnikvi.ruSuvorovaA AСувороваА А

младший научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology, Ministry of Healthcare of the Russian FederationФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России15062013893NO3 (2013)№3 (2013)344611032020Copyright ©; 2013, Kubanova A.A., Kubanov A.A., Frigo N.V., Volkov I.A., Rotanov S.V., Suvorova A.A.Copyright ©; 2013, Кубанова А.А., Кубанов А.А., Фриго Н.В., Волков И.А., Ротанов С.В., Суворова А.А.2013Kubanova A.A., Kubanov A.A., Frigo N.V., Volkov I.A., Rotanov S.V., Suvorova A.A.Кубанова А.А., Кубанов А.А., Фриго Н.В., Волков И.А., Ротанов С.В., Суворова А.А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://vestnikdv.ru/jour/article/view/594

The authors present the results of molecular typing and determining the antibiotic resistance of 190 T. pallidum strains sampled from primary and secondary syphilitic patients in the russian Federation in 2011—2012. molecular typing of T. pallidum strains was based on two variable gens: arp, tpr, and was supplemented with an analysis of gene tp0548 reading frame. Antibiotic resistance of syphilis strains was determined by means of sequencing the gene encoding 23S rRNA T. pallidum in such loci as A2058G and A2059G/C (resistance to macrolides), gene encoding 16S rRNA T. pallidum in locus G1058C, and determinant tetB (resistance to tetracyclines) as well as full-scale sequencing the genes encoding target proteins of β-lactams Tp47 and Tromp. As a result of molecular typing in the territory of the Russian Federation, ten subtypes of T. pallidum were revealed. Type 14 (98.4%) predominates; the share of subtype 14d/f is 91.03%; the share of subtypes 14d/Tand 14b/f, Type 14, was 2.10 and 3.16%, respectively; the share of all other subtypes (11d/f, 13d/f, 14a/a, 14a/f, 14d/g, 14d/c, 20d/f) was 0.53%. molecular markers of T. pallidum antibiotic resistance were revealed among the strains coming from the Central, Siberian and Volga federal regions of Russia: macrolides - three strains sampled in 2011; tetracyclines - two strains sampled in 2011 and one strain sampled in 2012.

Представлены результаты молекулярного типирования и определения антибиотикорезистентности 190 штаммов T. pallidum, полученных на территории Российской Федерации в 2011—2012 гг. от больных первичным и вторичным сифилисом. Молекулярное типирование штаммов T. pallidum проведено по двум вариабельным генам T. pallidum: arp, tpr и дополнено анализом последовательности рамки считывания гена tp0548. Определение антибиотикорезистентности штаммов возбудителя сифилиса проводилось путем секвенирования гена, кодирующего 23S rRNA T. pallidum в позициях A2058G и A2059G/C (резистентность к макролидам), гена, кодирующего 16S rRNA T. pallidum в позиции G1058C, и определения детерминанты tetB (резистентность к тетрациклинам), а также путем полноразмерного секвенирования генов, кодирующих белки-мишени ß-лактамов Tp47 и Tromp. В результате молекулярного типирования на территории Российской Федерации выявлено 10 субтипов T. pallidum. Установлено, что доминирующим является молекулярный тип 14 (98,4%), подтип 14d/f (91,03%); доля субтипов 14d/T и 14b/f молекулярного типа 14 составила: 2,10 и 3,16% соответственно; на долю каждого из остальных субтипов (11d/f, 13d/f, 14a/a, 14a/f, 14d/g, 14d/c, 20d/f) приходилось по 0,53%. Молекулярные маркеры резистентности T. pallidum к антибиотикам выявлены у штаммов, полученных из Центрального, Сибирского и Приволжского федеральных округов России: к макролидам — в трех штаммах, полученных в 2011 г.; к тетрациклинам — в двух штаммах, полученных в 2011 г., и в одном штамме, полученном в 2012 г.

T. pallidumtprtp054823S rRNA16S rRNATp47TrompsyphilisT. pallidummolecular typingsequencingantibiotic resistancegenes T. pallidum arptprtp054823S rRNA16S rRNATp47Trompсифилисмолекулярное типированиесеквенированиеантибиотикорезистентностьгены T. pallidum arpPillay A., Liu H., Chen C.Y. et al. Molecular subtyping of Treponema pallidum subspecies pallidum. Sex Transm Dis 1998; 25: 408—414.Pillay A., Liu H., Ebrahim S. et al. Molecular typing of Treponema pallidum in South Africa: cross-sectional studies. J Clin Microbiol 2002; 40: 256—258.Marra C.M., Sahi S.K., Tantalo L.C. et al. Enhanced Molecular Typing of Treponema pallidum: Geographical Distribution of Strain Types and Association with Neurosyphilis. J Infect Dis 2010; 202 (9): 1380—1388.Peng R.R., Wang A.L., Li J. et al. Molecular Typing of Treponema pallidum: A systematic review and metaanalysis. PLoS Negl Trop Dis. 2011 (Nov); 5 (11): e1273.Martin I.E., Gu W., Yang Y., Tsang R.S. Macrolide resistance and molecular types of Treponema pallidum causing primary syphilis in Shanghai, China. Clin Infect Dis 2009; 49: 515—521.Sutton M.Y., Liu H., Steiner B. et al. Molecular subtyping of Treponema pallidum in an Arizona County with increasing syphilis morbidity: use of specimens from ulcers and blood. J Infect Dis 2001; 183: 1601—1606.Martin I.E., Tsang R.S., Sutherland K. et al. Molecular typing of Treponema pallidum strains in western Canada: predominance of 14d subtypes. Sex Transm Dis 2010; 37: 544—548.Molepo J., Pillay A., Weber B. et al. Molecular typing of Treponema pallidum strains from patients with neurosyphilis in Pretoria, South Africa. Sex Transm Infect 2007; 83: 189—192.Florindo C., Reigado V., Gomes J.P. et al. Molecular typing of Treponema pallidum clinicalstrains from Lisbon, Portugal. J Clin Microbiol 2008; 46 (11): 3802—3803.Cole M.J., Chisholm S.A., Palmer H.M. et al. Molecular epidemiology of syphilis in Scotland. Sex Transm Infect 2009; 85: 447—451.Приказ Минздрава России № 327 от 25.07.2003 «Об утверждении протокола ведения больных «Сифилис».Duncan W.C. Failure of erythromycin to cure secondary syphilis in a patient infected with the human immunodeficiency virus. Arch Dermatol 1989; 125: 82—84.Hashisaki P., Wertzberger G.G., Conrad G.L., Nichols C.R. Erythromycin failure in the treatment of syphilis in a pregnant woman. Sex Transm Dis 1983; 10: 36—38.Stamm L.V., Bergen H.L. A point mutation associated with bacterial macrolide resistance is present in both 23S rRNA genes of an erythromycin-resistant Treponema pallidum clinical isolate. Antimicrob Agents Chemother 2000; 44: 806—807.Roberts M.C., Chung W.O., Roe D.E. Characterization of tetracycline and erythromycin resistance determinants in Treponema denticola. Antimicrob Agents Chemother 1996; 40 (7): 1690—1694.Roberts M.C. Update on acquired tetracycline resistance genes. FEMS Microbiol Lett 2005; 245 (2): 195—203.Norgard M.V., Miller J.N. Plasmid DNA in Treponema pallidum (Nichols): potential for antibiotic resistance by syphilis bacteria. Scince 1981; 213 (4507): 553—555.