Преспективы использования протеомных технологий в диагностике ИППП и заболеваний кожи



Цитировать

Полный текст

Аннотация

Представлены данные литературы, освещающие современные методы диагностики сифилиса, применяемые в Россий-
ской Федерации. Описана основная методическая база протеомики, приведены результаты применения протеомных
технологий в диагностике заболеваний, в том числе инфекционных, дана оценка перспектив и возможностей использо-
вания прямого протеомного профилирования для разработки нового метода диагностики сифилитической инфекции.

Об авторах

Н В КИТАЕВА

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

ведущий научный сотрудник отделения сифилидологии, д.м.н; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

Н В ФРИГО

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

главный научный сотрудник, заведующая отделом лабораторной диагностики ИПППи болезней кожи, д.м.н; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

С В РОТАНОВ

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

ведущий научный сотрудник отделения лабораторной диагностики сифилиса отделалабораторной диагностики ИППП и болезней кожи, д.м.н., доцент; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

Р Ф ХАЙРУЛИН

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

младший научный сотрудник отделения микробиологических методов диагностики; ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий»

Список литературы

  1. Дмитриев Г. А., Фриго Н. В. Сифилис. Дифференциальный клинико-лабораторный диагноз М.: Мед. книга, 2004.
  2. Johnson P. C., Farnie M. A.; Testing for syphilis. Dermatol Clin; 1994;12 (1); 9-17.
  3. Ресурсы и деятельность кожно-венерологических учреждений. Заболеваемость за 2002-2006 годы. Статистические материалы, М., 2003, 2004, 2005, 2006, 2007.
  4. Pangborn M. C.; A new serologically active phospholipids from beef heart. Proc Soc Exp Biol Med; 1949; 48 484-486.
  5. Приказ Минздрава Российской Федерации № 87 от 26.03.01 «О совершенствовании серологической диагностики сифилиса».
  6. Jurado R. L., Campbell J., Martin P. D.; Prozone phenomenon in secondary syphilis. Has its time arrived? Arch Intern Med; 1993;153 (21); 2496-2498.
  7. Говорун В. М., Арчаков А. И. Протеомные технологии в современной биомедицинской науке. Биохимия; 2002; 67 (10); 1341-1359.
  8. Czelusta A., Yen-Moore A., Van Der Straten M., et al.; An overview of sexually transmitted diseases. Part III. Sexually transmitted diseases in HIV-infected patients. J Am Acad Dermatol; 2000; 43 (3); 409-432; 433-406.
  9. Неспецифические положительные результаты серологических реакций на сифилис. Количественные модификации современных серологических реакций. Методические рекомендации. М., 1990.
  10. Nelson R. A., Mayer M. M.; Immobilization of treponema pallidum in vitro by antibody produced in syphilitic infection. The Journal of Experimental Medicine; 1949;89 (4); 369-393.
  11. Резайкина А. В. РИФ-абс с сывороткой крови, РИФц и РСК на холоде с ликвором в выявлении сифилиса среди соматических больных и декретированных контингентов: Автореф. дисс. канд. мед. наук. М.; 1979.
  12. Пшеничная Л. А. Материалы к изучению возможности выпадения ложноположительных результатов реакции иммобилизации бледных трепонем при некоторых хронических заболеваниях несифилитической этиологии.: Автореф. дисс. канд. мед. наук. М.; 1971
  13. Anderson R. I., Kent J. F., Sanders R. W.; Frozen syphilomatous rabbit testes as source of Treponema pallidum for the immobilization (TPI) test for syphilis. Am J Syph Gonorrhea Vener Dis; 1954; 38 (6); 527-530.
  14. Kern A.; Die problematic und Bedeutung der unspezifisch positiven- Reactionen in der Lues Serologie Derm Wschr 145 (25); 633.
  15. White M. Y., Van Eyk J. E.; Cardiovascular proteomics: past, present, and future. Mol Diagn Ther 2007;11 (22); 83-95.
  16. Дмитриев Г. А., Брагина Е. Е. Современные методы лабораторной диагностики сифилиса. Часть II. Вестн. дерматол., 1996; 3 33-38.
  17. Zhang Z., Bast R. C., Y. Y., et al.; Three Biomarkers Identified from Serum Proteomic Analysis for the Detection of Early Stage Ovarian Cancer. Cancer Research; 2004; 64 (16); 5882-5890.
  18. Беднова В. Н., Дмитриев Г. А., Бабий А. В. и др. Новая тест- система ИФА на сифилис. Вестн. дерматол. венерол.; 1994; 4 51.
  19. Рассказов Н. И., Ермолин Г. А., Чалов В. В. и др. Применение иммуноферментного анализа для регистрации специфических IgM-антител у больных сифилисом. Вестн. дерматол. венерол. 1990; 11 12-16.
  20. Backhouse J. L., Nesteroff S. I.; Treponema pallidum western blot: comparison with the FTA-ABS test as a confirmatory test for syphilis. Diagn Microbiol Infect Dis; 2001;39 (1); 9-14.
  21. Кубанова А. А., Фриго Н. В., Ротанов С. В., и др. Применение метода иммуноблоттинга для диагностики сифилиса с по-мощью коммерческой тест-системы INNO-LIA™ Syphilis Score. M.: 2005. 48.
  22. Ляхов В. Ф. Разработка иммуноферментного ловушечного метода определения IgM и IgG антител при сифилисе с помощью пероксидазного трепонемного конъюгата: Автореф. дисс. канд. мед. наук. М.; 1991.
  23. Scarlett C. J., Saxby A. J., Nielsen A., et al.; Proteomic profiling of cholangiocarcinoma: Diagnostic potential of SELDI-TOF MS in malignant bile duct stricture. Hepatology; 2006; 44 (3); 658-666.
  24. Рассказов Н. И., Ермолин Г. А., Ефремов Е. Е., и др. Возможные механизмы формирования ложной позитивности в иммуноферментном анализе. Вестн. дерматол. 1988;4 26-29.
  25. Сидорова Е. В., Ляхов В. Ф.; Значение определения противотрепонемных IgM - антител в серодиагностике сифилиса. ЗППП 1995; 4 11-14.
  26. Lobos P., Ortega R., Vera C., et al.; Prevalencia de serología falsa positiva para sífilis en una población de embarazadas. Rev Med Chil; 1992;120 (10); 1121-1126.
  27. Rawstron S. A., Mehta S., Marceffino L. E. A.; Congenital syphilis and fluorescent treponemal antibody test reactivity after the age of 1 year Sex. Transm. Dis; 1994; 280 319-324.
  28. Беднова В. Н., Тимченко Г. Ф. Сравнительное изучение РПГА с диагностикумами из патогенных и культуральных бледных трепонем при различных формах сифилиса. Вестн. дермат., 1987; 4 43-45.
  29. Дмитриев Г. А., Тимченко Г. Ф. Современное состояние реакции пассивной гемагглютинации в серодиагностике сифилиса. В кн. Кожные и венерические болезни. Сборник научных работ сотрудников ЦКВИ, посвященный 75-летию института. М.: 1996. 171-175.
  30. Лечение и профилактика сифилиса. Методические указания. М., 1999.
  31. Luger A. F., Schmidt B. L., Kaulich M.; Significance of laboratory findings for the diagnosis of neurosyphilis. Int J STD AIDS; 2000;11 (4); 224-234.
  32. Титов В. Н., Дугин С. Ф., Крылин В. В. Протеомика, метаболомика и будущее клинической лабораторной диагностики (лекция) КЛД; 2007; 1 23-34.
  33. Anderson N. L., Anderson N. G.; The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics; 2002;1 (11); 845-867.
  34. Дынник О. Б., Залесский В. Н. Современные биоаналитические (протеомные) технологии в лабораторной диагностике ревматических заболеваний. Укр. ревм. журнал, 2006; 2 (24); 17-24.
  35. Arevalo-Ferro C., Hentzer M., Reil G., et al.; Identification of quorum-sensing regulated proteins in the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa by proteomics. Environ Microbiol; 2003; 5 (12); 1350-1369.
  36. Liberatori S., Bini L., De Felice C., et al.; Acute-phase proteins in perinatal human plasma. Electrophoresis; 1997; 18 (3-4); 520-526.
  37. Власова М. А., Мошковский С. А., Сафарова М. Р. Молекулярная диагностика рака яичника с использованием протеомных технологий. Биомедицинская химия; 2005; 51 (4); 367-383.
  38. Weber G. F. U.; Kasuistischer Beitrag zur Unspezifitat des «Nelson- Testes» bie der Lues lateens. Z Hautkr 1973; 48 (18); 775-778.
  39. Humphery-Smith I., Cordwell S. J., Blackstock W. P.; Proteome research: complementarity and limitations with respect to the RNA and DNA worlds. Electrophoresis; 1997; 18 (8); 1217-1242.
  40. Link A. J. 2-D Proteome Analysis Protocols. New Jersey Humana Press; 1999.
  41. Matsui N. M., Smith-Beckerman D. M., Fishman J., et al. 2-D Proteome Analysis Protocols. New Jersey Humana Press; 1999.
  42. G. Y., W. S.-L., Meyer J. L., et al.; Proteomic Analysis of High- Grade Dysplastic Cervical Cells Obtained from ThinPrep Slides Using Laser Capture Microdissection and Mass Spectrometry. Journal of Proteome Research; 2007; 6 (11); 4256-4268.
  43. Link A. J., Eng J., Schieltz D. M., et al.; Direct analysis of protein complexes using mass spectrometry. Nat Biotechnol; 1999; 17 (7); 676-682.
  44. Issaq H. J., Veenstra T. D., Conrads T. P., et al.; The SELDI-TOF MS approach to proteomics: protein profiling and biomarker identification. Biochem Biophys Res Commun; 2002; 292 (3); 587-592.
  45. Veldkamp J., Visser A. M.; Application of Enzyme - linked Immunosorbent Assay (ELISA) in the serodiagnosis of syphilis. Br J Veneral Dis 1975; 51 227-231.
  46. Van Baar B. L.; Characterisation of bacteria by matrix-assisted laser desorption/ionisation and electrospray mass spectrometry. FEMS Microbiol Rev; 2000; 24 (2); 193-219.
  47. Diamandis E. P.; Point: Proteomic patterns in biological fluids: do they represent the future of cancer diagnostics? Clin Chem; 2003; 49 (8); 1272-1275.
  48. Young H.; Guidelines for serological testing for syphilis. Sexually transmitted infections; 2000; 76 (5); 403-405.
  49. Takikawa M., Akiyama Y., Maruyama K., et al.; Proteomic analysis of a highly metastatic gastric cancer cell line using two-dimensional differential gel electrophoresis. Oncol Rep 2006; 16 (4); 705-711.
  50. Melle C., Bogumil R., Ernst G., et al.; Detection and identification of heat shock protein 10 as a biomarker in colorectal cancer by protein profiling. PROTEOMICS; 2006;6 (8); 2600-2608.
  51. Holt G. E., Schwartz H. S., Caldwell R. L.; Proteomic profiling in musculoskeletal oncology by MALDI mass spectrometry. Clin Orthop Relat Res; 2006; 450 105-110.
  52. Faca V., Krasnoselsky A., Hanash S.; Innovative proteomic approaches for cancer biomarker discovery. Biotechniques; 2007; 43 (3); 279, 281-273, 285.
  53. Banerjee H. N., Verma M.; Use of nanotechnology for the development of novel cancer biomarkers. Expert Rev Mol Diagn; 2006; 6 (5); 679-683.
  54. Downes M. R., Byrne J. C., Dunn M. J., et al.; Application of proteomic strategies to the identification of urinary biomarkers for prostate cancer: a review. Biomarkers; 2006; 11 (5); 406-416.
  55. Lim M. S., Elenitoba-Johnson K. S.; Mass spectrometry-based proteomic studies of human anaplastic large cell lymphoma. Mol Cell Proteomics; 2006; 5 (10); 1787-1798.
  56. Sinz A., Bantscheff M., Mikkat S., et al.; Mass spectrometric proteome analyses of synovial fluids and plasmas from patients suffering from rheumatoid arthritis and comparison to reactive arthritis or osteoarthritis. Electrophoresis; 2002; 23 (19); 3445-3456.
  57. Trcka J., Kunz M.; Functional Genome and Proteome Analyses of Cutaneous Autoimmune Diseases. Curr Pharm Des 2006; 12 (29); 3787-3798.
  58. Wasinger V. C., Cordwell S. J., Cerpa-Poljak A., et al.; Progress with gene-product mapping of the Mollicutes: Mycoplasma genitalium. Electrophoresis; 1995; 16 (1); 1090-1094.
  59. Randolph T. W., Mitchell B. L., Mclerran D. F.; Quantifying peptide signal in MALDI-TOF mass spectrometry data. Mol Cell Proteomics; 2005; 4 (12); 1990-1999.
  60. Zhou L., Cheng L., Tao L., et al.; Detection of hypopharyngeal squamous cell carcinoma using serum proteomics. Acta Oto-laryngologica; 2006; 126 (8); 853-860.
  61. Vlahou A., Schorge J. O., Gregory B. W., et al.; Diagnosis of Ovarian Cancer Using Decision Tree Classification of Mass Spectral Data. J Biomed Biotechnol.; 2003; 5 308-314.
  62. Howard B. A., Wang M. Z., Campa M. J., et al.; Identification and validation of a potential lung cancer serum biomarker detected by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight spectra analysis. PROTEOMICS; 2003; 3 (9); 1720-1724.
  63. Khan N., Cromer C. J., Campa M., et al.; Clinical utility of serum amyloid A and macrophage migration inhibitory factor as serum biomarkers for the detection of nonsmall cell lung carcinoma. Cancer; 2004; 101 (2); 379-384.
  64. Kimura M., Tomita Y., Imai T., et al.; Significance of serum amyloid A on the prognosis in patients with renal cell carcinoma. Cancer; 2001; 92 (8); 2072-2075.
  65. Chait A., Han C. Y., Oram J. F., et al.; Thematic review series: The immune system and atherogenesis. Lipoprotein-associated inflammatory proteins: markers or mediators of cardiovascular disease? J Lipid Res; 2005; 46 (3); 389-403.
  66. Emanuel F. P., Ali M. A., Ben A. H., et al.; Use of proteomic patterns in serum to identify ovarian cancer. The Lancet; 2002; 359 (9306); 572-577.
  67. Cho W. C. S., Yip T. T. C., Yip C., et al.; Identification of Serum Amyloid A Protein As a Potentially Useful Biomarker to Monitor Relapse of Nasopharyngeal Cancer by Serum Proteomic Profiling. Clinical Cancer Research; 2004; 10 (1); 43-52.
  68. Massion P. P., Caprioli R. M.; Proteomic strategies for the characterization and the early detection of lung cancer. J Thorac Oncol; 2006; 1 (9); 1027-1039.
  69. Stockwin L. H., Blonder J., Bumke M. A., et al.; Proteomic Analysis of Plasma Membrane from Hypoxia-Adapted Malignant Melanoma. Journal of Proteome Research; 2006; 5 (11); 2996-3007.
  70. Ohshiro K., I. R. D., Koomen J. M., et al.; Pre-analytic saliva processing affect proteomic results and biomarker screening of head and neck squamous carcinoma. International journal of oncology; 2007; 30 (3); 743-749.
  71. Mian S., Ugurel S., Parkinson E., et al.; Serum Proteomic Fingerprinting Discriminates Between Clinical Stages and Predicts Disease Progression in Melanoma Patients. Journal of Clinical Oncology; 2005; 23 (22); 5088-5093.
  72. Xiang Y., Sekine T., Nakamura H., et al.; Proteomic surveillance of autoimmunity in osteoarthritis: Identification of triosephosphate isomerase as an autoantigen in patients with osteoarthritis. Arthritis & Rheumatism; 2004; 50 (5); 1511-1521.
  73. Drake R. R., Cazare L. H., Semmes O. J., et al.; Serum, salivary and tissue proteomics for discovery of biomarkers for head and neck cancers. Expert Rev Mol Diagn; 2005; 5 (1); 93-100.
  74. Carlen L. M., Sanchez F., Bergman A. C., et al.; Proteome analysis of skin distinguishes acute guttate from chronic plaque psoriasis. J Invest Dermatol; 2005; 124 (1); 63-69.
  75. Hueber W., Robinson W. H.; Proteomic biomarkers for autoimmune disease. PROTEOMICS; 2006; 6 (14); 4100-4105.
  76. Turner M. W.; Mannose-binding lectin: the pluripotent molecule of the innate immune system. Immunology Today; 1996; 17 (11); 532-540.
  77. Feghali-Bostwick C. A.; Genetics and proteomics in scleroderma. Curr Rheumatol Rep; 2005; 7 (2); 129-134.
  78. Lucchese A., Willers J., Mittelman A., et al.; Proteomic scan for tyrosinase peptide antigenic pattern in vitiligo and melanoma: role of sequence similarity and HLA-DR1 affinity. J Immunol; 2005; 175 (10); 7009-7020.
  79. X. W. H., Chen Y. D., H. Y., et al.; Preoperatively molecular staging with CM10 ProteinChip and SELDI-TOF-MS for colorectal cancer patients. Journal of Zhejiang University. Science. B; 2006; 7 (3); 235-240.
  80. Andrew B. S., James L. M., Susan J. M., et al.; Expression of Annexin I, II and VII Proteins in Androgen Stimulated and Recurrent Prostate Cancer. The Journal of urology; 2004; 171 (2); 916-920.
  81. Rathlev T.; Haemagglutination test utilizing pathogenic Treponema pallidum for the sero-diagnosis of syphilis. The British journal of venereal diseases; 1967; 43 (3); 181-185.
  82. Wilson L. L., Tran L., Morton D. L., et al.; Detection of Differentially Expressed Proteins in Early-Stage Melanoma Patients Using SELDI-TOF Mass Spectrometry. Annals of the New York Academy of Sciences; 2004; 1022 (1); 317-322.
  83. Chen J. H., Chang Y. W., Yao C. W., et al.; Plasma proteome of severe acute respiratory syndrome analyzed by two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry. Proc Natl Acad Sci U S. A; 2004; 101 (49); 17039-17044.
  84. Eckersall P. D., Duthie S., Toussaint M. J., et al.; Standardization of diagnostic assays for animal acute phase proteins. Adv Vet Med; 1999; 41 643-655.
  85. Eisen D. P., Minchinton R. M.; Impact of mannose-binding lectin on susceptibility to infectious diseases. Clin Infect Dis; 2003; 37 (11); 1496-1505.
  86. Hartshorn K. L., Sastry K., White M. R., et al.; Human mannosebinding protein functions as an opsonin for influenza A viruses. J Clin Invest; 1993; 91 (4); 1414-1420.
  87. Uchida T., Fukawa A., Uchida M., et al.; Application of a Novel Protein Biochip Technology for Detection and Identification of Rheumatoid Arthritis Biomarkers in Synovial Fluid. Journal of Proteome Research; 2002; 1 (6); 495-499.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© КИТАЕВА Н.В., ФРИГО Н.В., РОТАНОВ С.В., ХАЙРУЛИН Р.Ф., 2010

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 60448 от 30.12.2014.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах