Разработка протокола молекулярноготипирования C. Trachomatis на основесеквенирования генов ompa, pbpb, ct046, ct058,ct144, ct172



Цитировать

Полный текст

Аннотация

Статья посвящена разработке и апробации стандартной операционной процедуры «Молекулярное типирование
С.trachomatis для оценки клональной структуры и степени генетического разнообразия штаммов С.trachomatis,
циркулирующих на территории Российской Федерации». В результате проведенных исследований по типированию
штаммов c. trachomatis, полученных из регионов Российской Федерации с использованием 6 генов c. trachomatis
(ompA, СТ046, cT058, cT144, cT172 и pbpB), была установлена их значительная гетерогенность с преобладанием
серотипа Е. Однако проведение типирования c. trachomatis одновременно по шести генам представляется излишне
трудоемким, длительным во времени, трудно интерпретируемым, что определяет необходимость разработки
других Протоколов типирования с использованием меньшего числа (не более 2-3 - по аналогии с NG-MAST)
значимых генов.

Об авторах

Н В Фриго

ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

д.м.н., главный научный сотрудник отдела лабораторной диагностикиИППП и болезней кожи; ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

В С Соломка

ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

к.б.н., старший научный сотрудник отдела лабораторной диагностикиИППП и болезней кожи; ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

О С Кожушная

ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

младший научный сотрудник отдела лабораторной диагностикиИППП и болезней кожи; ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

М Р Рахматулина

ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

д.м.н., и.о. заведующего отделом инфекций, передаваемыхполовым путем; ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

К И Плахова

ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

к.м.н., старший научный сотрудник отдела инфекций, передаваемыхполовым путем; ФГБУ «ГНЦДК Минздравсоцразвититя России»

N V FRIGO

V S SOLOMKA

O S KOZHUSHNAYA

M R RAKHMATULINA

K I PLAKHOVA

Список литературы

  1. Заболеваемость, ресурсы и деятельность дерматовенерологических учреждений в 2008 году (статистические материалы). Москва: Министерство здравоохранения и социального развития Российской Федерации, Департамент развития медицинской помощи и организации здравоохранения ФГУ «Центральный научно-исследовательский институт организации и информатизации здравоохранения», 2009.
  2. Stothard D. R. Use of a reverse dot blot procedure to identify the presence of multiple serovars in Chlamydia trachomatis urogenital infection. J Clin Microbiol 2001; 39: 2655-2659.
  3. Spaargaren J., Verhaest I., Mooi J.S. et al. Analysis of Chlamidya trachomatis. Serovar distribution changes in the Netherlands (1986-2002). Sex Transm Infect 2004; 80: 151-152.
  4. Wang S.P., Kuo C.C., Barnes R.C. et al. Immunotyping of Chlamidya trachomatis with monoclonal antibodies. J Infect Dis 1985; 152: 791-800.
  5. Osserwarde J.M., Rieffe M. De Vries., Derksen-Navrocki R.P. et al. Comparison of two panels of monoclonal antibodies for determination of Chlamidya trachomatis serovars. J Clin Microbiol 1994; 32: 2968-2974.
  6. Stothard D.R. Use of a reverse dot blot procedure to identify the presence of multiple serovars in Chlamydia trachomatis urogenital infection. J Clin Microbiol 2001; 39: 2655-2659.
  7. Xiong L., Kong F., Zhou H., Gilbert G.L. Use of PCR and reverse line blot hybridization assay for rapid simultaneous detection and serovar identification of Chlamydia trachomatis. J Clin Microbiol 2006; 44: 1413-1418.
  8. Zheng H.P., Jiang L.F., Fang D.Y. et al. Application of an oligonucleotide array assay for rapid detecting and genotyping of Chlamydia trachomatis from urogenital specimens. Diagn Microbiol Infect Dis 2007; 57: 1-6.
  9. Bandea C.I., Kubota K., Brown T.M. et al. Typing of Chlamydia trachomatis strains from urine samples by amplification and sequencing the major outer membrane protein gene (omp1). Sex Transm Infect 2001; 77: 419-422.
  10. Klint M., Lofdahl M., Ek C. et al. Lymphogranuloma venereum prevalence in Sweden among men who have sex with men and characterization of Chlamydia trachomatis ompA genotypes. J Clin Microbiol 2006; 44: 4066-4071.
  11. Stothard D.R., Boguslawski G., Jones R.B. Phylogenetic analysis of the Chlamydia trachomatis major outer membrane protein and examination of potential pathogenic determinants. Infect Immun 1998; 66: 3618-3625.
  12. Jalal H., Stephen H., Alexander S. et al. Development of real-time PCR assays for genotyping of Chlamydia trachomatis. J Clin Microbiol 2007; 45: 2649-2653.
  13. Feavers I.M., Gray S.J., Urwin R. et al. Multilocus sequence typing and antigen gene sequencing in the investigation of a meningococcal disease outbreak. J Clin Microbiol 1999; 37: 3883-3887.
  14. Klint M., Fuxelius H.H., Goldkuhl R.R. et al. High-resolution genotyping of Chlamydia trachomatis strains by multilocus sequence analysis. J Clin Microbiol 2007; 45: 1410-1414.
  15. Zhang Y., Tao J., Zhou M. et al. Elongation factor Ts of C.trachomatis: structure of the gene and properties of the protein. Arch Biochem Biophys 1997; 344: 43-52.
  16. Gomes J.P., Nunes A., Bruno W.J. et al. Polymorphisms in the Nine Polymorphic Membrane Proteins of C.trachomatis across All Serovars: Evidence for Serovar Da recombination and Correlation with Tissue Tropism. J Bacteriol 2006; 188: 1: 275-286.
  17. Klint M., Fuxelius H.H., Goldkuhl R.R. et al. High-resolution genotyping of Chlamydia trachomatis strains by multilocus sequence analysis. J Clin Microbiol 2007; 45: 1410-1414.
  18. Pannekoek Y., Morelli G., Kusecek B. et al. Multi locus sequence typing of Chlamydiales: clonal groupings within the obligate intracellular bacteria Chlamydia trachomatis. BMC Microbiol 2008; 8: 42.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Фриго Н.В., Соломка В.С., Кожушная О.С., Рахматулина М.Р., Плахова К.И., FRIGO N.V., SOLOMKA V.S., KOZHUSHNAYA O.S., RAKHMATULINA M.R., PLAKHOVA K.I., 2011

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 60448 от 30.12.2014.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах